院长任上，蔡元培依旧奉行他的“人才至上”主义，不拘一格选用科学方面的专家。

        理工方面，物理研究所聘丁西林为所长，严济慈、胡刚复、杨肇燫等为研究员。

        化学研究所聘王琎为所长，赵燏黄、沈慈辉、曾义为研究员。

        工程研究所聘请周仁为所长，王季同、周行健等为研究员。

        地质研究所聘李四光为所长，翁文灏、叶良辅、徐渊摩等为研究员。

        气象研究所聘竺可桢为所长，胡焕庸等为研究员。

        天文研究所聘请俞青松为所长，陈遵妫、高平子为研究员。

        心理研究所由康钺任所长。

        人文方面，历史语言所由傅斯年任所长，陈寅恪、赵元任、李济分别任历史组、语言组、考古组主任，研究员有陈垣、刘半农、徐中舒、罗常培、史禄国(白俄学者)等。

        社会科学研究所由杨端六任所长，后由蔡元培本人兼任。经济组主任杨杏佛，研究员杨端六、吴定良，特约研究员刘大钧、王琎、何廉、蒋廷黻等。法制组主任王云五，特约研究员周鲠生、王世杰、胡长青等。社会组主任陈翰笙，研究员王济昌，特约研究员陶孟和；民族组主任蔡元培，研究员有德国学者但泽、凌纯声。

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