“师弟,给个邮箱,我把需要分析的数据和需求发给你,有什么不懂的就来问我。”
“好!”胡彪点了点头,把自己的邮箱报了出来,接收了数据,然后认真的看了起来。
他一个刚刚插队进入分析的大一新生,第一天进组能干什么?
当然是先熟悉分析室的情况喽。
就这么看了半小时,秦语突然推着一个白板走到了实验室的中心,然后拍了拍手。
“好了,大家都过来吧,对照组那边刚刚发来一组数据,需要分析,要的很急,大家都来看看!”
秦语一边说,一边拿着笔在白板上写着,不多时,小白板上就布满了符文一般的数学符号和数据,“这是一组与神经退行性疾病相关的长链非编码RNA序列。这些序列在不同物种间保守性极低,但临床数据又强烈提示它们可能在疾病发生中起调控作用。”
“问题在于,”秦语指着白板上的一串序列比对图,“用传统的Clustal Omega、MAFFT这些工具比对,结果简直一团糟。高变区域完全无法对齐,更别提识别可能的功能模块了。”
这时,李薇适时补充道:“公司那边希望能在年底前锁定几个有潜力的靶点进入初步筛选。如果序列比对这关都过不了,后续的保守性分析、二级结构预测、互作网络构建全都无从谈起。”
陈浩然看着白板上的内容,眉头微微一挑,转头对胡彪道,“师弟,你看看这几组序列,适不适用你提出的多序列对比算法,我记得你的论文里有相关的内容。”
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