郑芝龙的水师在台湾海峡巡逻时，遭遇葡萄牙商船队。葡萄牙人自持船坚炮利，拒绝接受检查，双方发生冲突。郑芝龙击沉葡船一艘，俘获两艘，缴获货物价值三十万两。

        葡萄牙驻澳门总督遣使抗议，声称大明水师“无故攻击友邦商船”。

        “友邦？”朱由检冷笑，“嘉靖年间，葡萄牙人强占澳门，杀戮百姓，何来友邦之说？”

        他召见徐光启、李长庚商议。

        徐光启道：“皇上，泰西诸国，葡萄牙最先来华，占据澳门已近百年。其火炮、造船技术确有可取之处。臣以为，可借此机会，迫其让出部分权益。”

        “如何迫？”

        “令其交出澳门炮台、船厂，由大明水师接管。准其继续贸易，但须纳重税，守律法。”徐光启建议，“若其不从，则封锁澳门，断其贸易。”

        李长庚补充：“葡萄牙人近年势衰，荷兰人崛起，与其争夺南洋。我可联荷制葡，迫其就范。”

        朱由检沉思。澳门问题迟早要解决，如今正是时机。

        “传旨郑芝龙：第一，继续施压，但不主动攻击。第二，接触荷兰使者，商讨联合对付葡萄牙之可能。第三，命广东水师集结，做出进攻澳门之势。”

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