这实际上便彻底废除了“以文御武”的体制，并以蜀王府控制下的集体领导体制取而代之。

        在集体领导体制下，文人与文官、武人与武职彻底分开。个人入仕道路的不同，只是授官的参考而已，不是终身的身份。文武官员平起平坐，仅有职责分工不同。文人也可以领兵，但前提是他必须有蜀王府赋予的军事指挥权。没有这种权力，文官无权插手军队的事情。武人也可以插手地方，前提是必须有上级认可的集体决议。这样一来，文武便进行了深度的整合。在集体领导的大框架内，既制衡又合作。

        废除“以文御武”，廖大亨自己的领兵权也被废了。不甘自废武功廖大亨具有的丰富官场经验，立即提出了一个替代的方案，既可以使他不至于大权旁落，也可以使他登上权力之巅那就是在蜀世子殿下之下，三总部之上，设立一个更高层级的指挥机构，辅佐日理万机的世子殿下。

        朱平槿当然不会在政治交换的紧要当口与廖大亨讨价还价。善于创设新式机构的朱平槿当即插言，废除承运朝会之后设立的军机委员会，另在蜀王府设立军机处，作为自己的军事统御机构。

        廖大亨、马乾、陈其赤、郑安民、曹三保、程翔凤、舒国平、孙洪、王昆山等九人为军机大臣，入值军机处。廖大亨以四川巡抚身份兼任首席军机。另外，再增补王府文案李长祥、张维、谭芳，抚台幕友孙定邦等人为军机秘书。

        马乾的兵备副使已经没有多少实质内容，入值军机处，他便成为了军机处里唯一的专职军机。此外，马乾还管着官军的编遣善后大权，明眼人立即清楚，马大人简在世子之心，要大用了。

        至于女人谭芳意外入值军机处，则是世子亲自提名，目的是保证罗姑娘能通过她的秘书随时掌握军事动态，保证军队用度不缀。

        廖大亨奏疏中所谓的“全民皆兵”，即是洪其惠在承运朝会中提出的所谓现役、正役、预备役三级兵役制度的翻版。廖大亨在奏疏中正式提出这个制度，就是把全民义务兵役制由王庄扩展到了全省。

        只是由于川北各地的人口损失明显大于预期，为了保证护国军的兵源充沛，廖大亨建议将“丁”的概念，明确为蜀地十五至四十岁的健康男子。现役由二十丁抽一改为十五丁抽一，正役和预备役抽丁比例维持不变。

        廖大亨估算，这样全省可以维持现役常备军九至十万，经过训练的正役二十五万左右。如果再加上荆楚征集的新兵以及从行都司调来的军队，可以将常备军增加到十二万左右。此数虽较闯献流贼总数少得多，但只要士气高昂、装备精良、粮饷充沛，亦能战而胜之。

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